一部のキャンペーンだけ自動配分の対象から外せますか？

外せます。設定済みの自動運用を編集する際、「Edit Settings」 から起動する編集フローでキャンペーンごとに配分対象のON/OFFを切り替えられます。

デフォルトでは全キャンペーンがON（オプトアウト方式）です。OFFにしたキャンペーンは、DECA Adが日予算を変更せず、媒体側の現在の日予算がそのまま維持されます。

編集フローでは、1本以上のキャンペーンを配分対象ONにしないと次の画面へ進めません。すべてのキャンペーンをOFFにすることはできません。